Persebaran fauna di Indonesia menurut Wallace terbagi dalam 3 kepingan, ialah bagian barat, pecahan peralihan, dan cuilan timur. Ketiga wilayah ini dipisahkan oleh Garis Wallace dan Garis Weber
- 1. Region fauna Indonesia barat
Habitat spesies fauna Indonesia kepingan barat lazimnya berada di hutan-hutan yang lebat dengan pohon-pohon yang besar. Hal ini pastinya memengaruhi ukuran badan spesies fauna di kawasan ini yang besar dan bervariasi.
- 2. Region fauna Indonesia Tengah
Habitat spesies fauna Indonesia pecahan tengah didominasi oleh hutan yang tidak terlalu lebat serta padang rumput. Kondisi vegetasi tumbuhan seperti seperti ini ikut memengaruhi kurang bervariasinya spesies fauna yang mendiami daerah ini.
- 3. Region fauna Indonesia Timur
Jumlah curah hujan yang tinggi dan vegetasi tanaman yang bervariasi mengakibatkan spesies fauna yang menempati daerah Indonesia belahan timur juga bervariasi mirip halnya spesies fauna di Indonesia penggalan barat.