Sel prokariotik memiliki struktur yang lebih sederhana ketimbang sel eukariotik.
| Pembeda | Sel eukariotik | Sel prokariotik |
|---|---|---|
| Keberadaan membran inti | Memiliki membran inti sel | Tidak mempunyai membran inti sehingga materi inti dalam sel menyelenggarakan kontak langsung dengan protoplasma. |
| Kelompok anggotanya | Kingdom Plantae, Animalia, dan Fungi | Hanya terdapat pada kingdom Monera yang mencakup semua jenis bakteri. |
| Keberadaan sistem endomembran | Memiliki metode endomembran | Tidak mempunyai sistem endomembran |