Hasil selesai pemilu menunjukan bahwa Golkar menerima suara terbanyak. Partai Demokrat dan Partai Keadilan Sejahtera (PKS), dua partai modern dalam pemilu ini, menerima 7,45% dan 7,34%.
Pemilu legislatif 2004 ialah pemilu paling rumit dalam sejarah Indonesia sebab penduduk Indonesia mesti memilih wakil rakyat di dewan perwakilan rakyat, DPD dan DPRD. Faktor tersebut menjadikan tata cara pemilihan Indonesia unik jika daripada negara-negara lain di dunia. Pemilu ini juga dinyatakan sebagai pemilihan terpanjang dan paling rumit dalam sejarah demokrasi. Bahkan sistem alokasi dingklik DPR juga dianggap sebagai “yang paling rumit di dunia” oleh media.
Tujuh partai politik memenuhi standar untuk menyalonkan kandidatnya dalam pemilu presiden 2004: Golkar, Partai Demokrasi Indonesia Perjuangan (PDI-P), Partai Kebangkitan Bangsa (PKB), Partai Persatuan Pembangunan (PPP), Partai Demokrat, Partai Keadilan Sejahtera (PKS) dan Partai Amanat Nasional (PAN). PKS tidak mencalonkan kandidatnya, tetapi mendukung capres dari PAN.