Pepaya mengandung vitamin A, vitamin B, vitamin C, kalium, kalsium, magnesium, karbohidrat, dan papain. Pepaya juga mengandung serat dengan kadar 1,3 gram per 100 gram.
Papain dalam pepaya berfungsi untuk mengurai protein dalam usus dan memperlancar keluarnya air susu. Selain itu, papain juga merupakan salah satu enzim protease bermanfaat untuk membantu mempercepat penyembuhan luka dan membantu proses pencernaan protein. Pepaya juga mengandung karpaina, yaitu suatu alkaloid yang berfungsi untuk meminimalkan serangan jantung, peluruh cacing, menanggulangi sariawan, mengatasi infeksi, meredakan demam, melancarkan jalan masuk pencernaan, dan menghalangi konstipasi (sembelit). Jika dicampur dengan mangga bisa mengurangi pembengkakan dan peradangan. Selain itu, selaku anti amuba, anti kanker, dan antioksidan.