Batuan sedimen organik terbentuk dari larutan-larutan dengan sumbangan organisme baik tumbuh-tanaman maupun binatang lewat proses biokimia dan biomekanik.
Oleh alasannya itu bahu-membahu antara sedimen organik dan sedimen kimia susah dipisahkan secara konkret.
Batuan kapur merupakan pola batuan sedimen yang di samping terbentuk secara kimia juga terbentuk secara organik.
Batuan sedimen yang mengandung silisium terbentuk dari asam silisium dengan perantaraan hewan radiolaria atau berkembang-berkembang diatomea (batuan radiolarit dan diatomit).
Batubara terbentuk pada keadaan air berawa dari sisa berkembang-flora yang proses pembusukannya tidak sempurna.
Karena tertimbun oleh endapan seperti pasir dan lempung dalam rentang waktu sungguh lama, zat karbon (C) secara relatif akan makin banyak dibandingkan dengan unsur-unsur lain. Pada proses pembentukan batubara akan keluar antara lain N₂, O₂ dan H₂.
Stadium pertama pembentukan batubara yaitu berupa gambut (peat) yang berwarna kuning, coklat atau hitam.
Pada stadium ini kandungan karbon masih rendah adalah antara 52% – 62%. Stadium kedua berupa lignit atau batubara muda atau batubara coklatberupa massa padat berwarna coklat atau hitam dengan kandungan karbon 63% – 70%.
 |
| Batubara |
Stadium selanjutnya terbentuk batubara berupa massa yang lebih padat daripada lignit, berwarna hitam dengan kandungan karbon 71% – 82%.
Pada stadium ini tidak mampu dilihat lagi struktur dari berkembang-tumbuhan. Jika tekanan dan temperatur berkembanglagi, batubara akan mengalami metamorfosis menjadi antrasit nerupa massa padat dan keras, berwarna hitam keabu-abuan, kandungan karbonnya meningkat hingga 95%.
Stadium terakhir dari pembentukan batubara dinamakan grafit dengan kandungan karbon meraih 99% dan sungguh keras.
Diatome terbentuk dari akumulasi endapan kerangka tanaman bersel satu diatomae yang berkembang pada dasar maritim atau danau lembap asin. Endapan diatomae ini mampu didapatkan di kubah Sangiran. Karang dibangun oleh organisme koral dan algae calcareous.
Syarat hidup koral adalah dasar bahari dapat ditembus oleh cahaya matahari, adalah dengan kedalaman kurang dari 50 meter, temperatur air sekitar 21 – 26°C, dan airnya jernih.Karang berkembang dari dasar bahari menuju ke atas.
Dengan demikian ketebalan maksimun karang yakni sekitar 50 meter. Pada kenyataannya dapat ditemukan lapisan batuan kapur ketebalannya lebih dari 50 meter.
Hal inimerupakan indikator bahwa selama pembentukan karang tersebut dasar bahari mengalami penurunan sebelum lalu terangkat menjadi sebuah pegunungan.